From b84ca42b2a3c2deb54e90c29f7130d84069d8e37 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Alessio Siniscalchi Date: Wed, 31 Jul 2024 14:08:51 +0200 Subject: [PATCH] postgres-specific code removed (#123) * postgres-specific code removed * add unit tests * remove debug print * qa * fix test * better handling of wdir * qa --------- Co-authored-by: Mattia Almansi --- cacholote/database.py | 83 +++++++++++++++++++++++----------------- cacholote/utils.py | 14 ++++++- tests/test_02_utils.py | 8 ++++ tests/test_70_alembic.py | 22 +++++++++++ 4 files changed, 91 insertions(+), 36 deletions(-) create mode 100644 tests/test_70_alembic.py diff --git a/cacholote/database.py b/cacholote/database.py index 136f056..16d480c 100644 --- a/cacholote/database.py +++ b/cacholote/database.py @@ -111,7 +111,7 @@ def _decode_kwargs(**kwargs: Any) -> dict[str, Any]: def _cached_sessionmaker( url: str, **kwargs: Any ) -> sa.orm.sessionmaker[sa.orm.Session]: - engine = sa.create_engine(url, **_decode_kwargs(**kwargs)) + engine = init_database(url, **_decode_kwargs(**kwargs)) Base.metadata.create_all(engine) return sa.orm.sessionmaker(engine) @@ -120,44 +120,57 @@ def cached_sessionmaker(url: str, **kwargs: Any) -> sa.orm.sessionmaker[sa.orm.S return _cached_sessionmaker(url, **_encode_kwargs(**kwargs)) -def init_database(connection_string: str, force: bool = False) -> sa.engine.Engine: +def init_database( + connection_string: str, force: bool = False, **kwargs: Any +) -> sa.engine.Engine: """ Make sure the db located at URI `connection_string` exists updated and return the engine object. - :param connection_string: something like 'postgresql://user:password@netloc:port/dbname' - :param force: if True, drop the database structure and build again from scratch + Parameters + ---------- + connection_string: str + Something like 'postgresql://user:password@netloc:port/dbname' + force: bool + if True, drop the database structure and build again from scratch + kwargs: Any + Keyword arguments for create_engine + + Returns + ------- + engine: Engine """ - engine = sa.create_engine(connection_string) + engine = sa.create_engine(connection_string, **kwargs) migration_directory = os.path.abspath(os.path.join(__file__, "..")) - os.chdir(migration_directory) - alembic_config_path = os.path.join(migration_directory, "alembic.ini") - alembic_cfg = alembic.config.Config(alembic_config_path) - for option in ["drivername", "username", "password", "host", "port", "database"]: - value = getattr(engine.url, option) - if value is None: - value = "" - alembic_cfg.set_main_option(option, str(value)) - if not sqlalchemy_utils.database_exists(engine.url): - sqlalchemy_utils.create_database(engine.url) - # cleanup and create the schema - Base.metadata.drop_all(engine) - Base.metadata.create_all(engine) - alembic.command.stamp(alembic_cfg, "head") - else: - # check the structure is empty or incomplete - query = sa.text( - "SELECT table_name FROM information_schema.tables WHERE table_schema='public'" - ) - conn = engine.connect() - if "cache_entries" not in conn.execute(query).scalars().all(): + with utils.change_working_dir(migration_directory): + alembic_config_path = os.path.join(migration_directory, "alembic.ini") + alembic_cfg = alembic.config.Config(alembic_config_path) + for option in [ + "drivername", + "username", + "password", + "host", + "port", + "database", + ]: + value = getattr(engine.url, option) + if value is None: + value = "" + alembic_cfg.set_main_option(option, str(value)) + if not sqlalchemy_utils.database_exists(engine.url): + sqlalchemy_utils.create_database(engine.url) + # cleanup and create the schema + Base.metadata.drop_all(engine) + Base.metadata.create_all(engine) + alembic.command.stamp(alembic_cfg, "head") + elif "cache_entries" not in sa.inspect(engine).get_table_names(): + # db structure is empty or incomplete force = True - conn.close() - if force: - # cleanup and create the schema - Base.metadata.drop_all(engine) - Base.metadata.create_all(engine) - alembic.command.stamp(alembic_cfg, "head") - else: - # update db structure - alembic.command.upgrade(alembic_cfg, "head") + if force: + # cleanup and create the schema + Base.metadata.drop_all(engine) + Base.metadata.create_all(engine) + alembic.command.stamp(alembic_cfg, "head") + else: + # update db structure + alembic.command.upgrade(alembic_cfg, "head") return engine diff --git a/cacholote/utils.py b/cacholote/utils.py index 2a6d420..f8c58ab 100644 --- a/cacholote/utils.py +++ b/cacholote/utils.py @@ -16,15 +16,17 @@ # limitations under the License.import hashlib from __future__ import annotations +import contextlib import dataclasses import datetime import functools import hashlib import io +import os import time import warnings from types import TracebackType -from typing import Any +from typing import Any, Iterator import fsspec @@ -129,3 +131,13 @@ def __exit__( def utcnow() -> datetime.datetime: """See https://discuss.python.org/t/deprecating-utcnow-and-utcfromtimestamp/26221.""" return datetime.datetime.now(tz=datetime.timezone.utc) + + +@contextlib.contextmanager +def change_working_dir(working_dir: str) -> Iterator[str]: + old_dir = os.getcwd() + os.chdir(working_dir) + try: + yield os.getcwd() + finally: + os.chdir(old_dir) diff --git a/tests/test_02_utils.py b/tests/test_02_utils.py index 99b3511..b1a4c9b 100644 --- a/tests/test_02_utils.py +++ b/tests/test_02_utils.py @@ -1,5 +1,6 @@ from __future__ import annotations +import os import pathlib import fsspec @@ -29,3 +30,10 @@ def test_copy_buffered_file(tmp_path: pathlib.Path) -> None: with open(src, "rb") as f_src, open(dst, "wb") as f_dst: utils.copy_buffered_file(f_src, f_dst) assert open(src, "rb").read() == open(dst, "rb").read() == b"test" + + +def test_change_working_dir(tmp_path: pathlib.Path) -> None: + old_cwd = os.getcwd() + with utils.change_working_dir(str(tmp_path)) as actual: + assert actual == os.getcwd() == str(tmp_path.resolve()) + assert os.getcwd() == old_cwd diff --git a/tests/test_70_alembic.py b/tests/test_70_alembic.py new file mode 100644 index 0000000..01fdec4 --- /dev/null +++ b/tests/test_70_alembic.py @@ -0,0 +1,22 @@ +import pathlib +import time + +import pytest + +from cacholote import cache, config + +OLD_DB = b"SQLite format 3\x00\x10\x00\x01\x01\x00@ 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